ซีรี่ย์ภาค EXE เป็นเนื้อเรื่องใหม่ไม่เกี่ยวข้องใดๆกับภาคก่อนๆเลยครับ เป็น timeline ใหม่ไปเลย (ซึ่ง timeline นี้จะมีแค่ 2 ซีรี่ย์คือ EXE แล้วต่อด้วย Star Force)

ส่วนซีรี่ย์ภาค Zero นั้นเนื้อเรื่องจากต่อจากซี่รี่ย์ภาค X ครับ จริงๆตอนแรกเฮียอินาฟุเนะจะให้เป็นเนื้อเรื่องต่อจากภาค X5 ด้วย (สปอยฉากจบ X5)

แต่เพราะแคปหมูแอบสั่งทีมงานคนอื่นให้ทำภาค X6 และภาค X ต่อๆมาก็เลยทำให้เฮียอินาฟุเนะต้องแก้ไขเนื้อเรื่องภาค Zero ภาคหลังๆให้เข้ากับภาคหลังจากภาค X6