บทสรุป แมสส์ เอฟเฟคต์ 3 (Mass Effect 2012)

โดย: "MnemoniC"



สตูดิโอพัฒนา- ไบโอแวร์
ดูแลการผลิตโดย- เคซี่ย์ ฮัดสัน
ประเภทเกมส์- แอ็คชั่นชู้ตเตอร์, สวมบทบาท
จัดจำหน่ายโดย- อีเล็กทรอนิค อาร์ตส์
แพลตฟอร์ม- วียู, เอ็กซ์ บ็อกซ์ 360, เอ็กซ์ บ็อกซ์ วัน, เพลย์สเตชั่น 3, เพลย์สเตชั่น 4 และ วินโดว์

ระบบการเล่น, ข้อมูลเบื้องต้น
- ตัวละคร, คลาสอาชีพ (Classes) เมื่อเริ่มเล่นเกมให้ผู้เล่นเลือกเพศ, คลาสสายอาชีพ และรูปร่างหน้าตาตัวละครหลัก หากมีบันทึกจากเกมภาคสองสามารถใช้ตัวละครเก่ามาดำเนินเกมต่อได้ จะแบ่งเป็น 6 อาชีพได้แก่ โซลเยอร์, เอ็นจีเนียร์, อะแด็ปต์, อินฟิลเทรเตอร์, เซนติเนล และ แวนการ์ด โดยความแตกต่างของแต่ละอาชีพคือประเภทของอาวุธปืนที่ใช้ รวมถึงความสามารถของสกิลที่จะแยกประเภทตามสายคลาสอาชีพ
- ระบบการต่อสู้ ระบบการต่อสู้เมื่อเข้าดันเจี้ยนด่านภารกิจผู้เล่นสามารถเลือกตัวละครเข้าปาร์ตี้ได้ 3 คน ขณะต่อสู้ผู้เล่นสามารถกำหนดแท็คติคทีมในการใช้อาวุธหรือสกิล รวมถึงกำหนดจุดตำแหน่งคัฟเวอร์ของปาร์ตี้ได้อย่างอิสระ สามารถอัพเกรดอาวุธ และ สกิลลูกทีมตามความถนัดของผู้เล่นได้ทุกคน มีระบบตั้งค่าการใช้ออโต้สกิลของปาร์ตี้ในทีม โดยต้องไปที่เซ็ตติ้งของเกมเลือกหัวข้อไม่ใช้สควอดเมท พาวเวอร์ หรือ ใช้สควอดเมท พาวเวอร์
- ระบบเพิ่มเลเวลค่าประสบการณ์ของผู้เล่น(EXP) จะเพิ่มค่าความสามารถตามสกิลที่เลือกติดตั้งให้ตัวละคร ความสามารถด้านกายภาพหรือเทคโนโลยีไบโอติกเวทย์มนต์ จะแตกต่างกันตามที่ผู้เล่นเลือกพัฒนาให้ตัวละคร ทั้งตัวละครที่ผู้เล่นเลือกใช้งานเองและตัวละครในทีมปาร์ตี้ทุกคน

- ในขณะต่อสู้เมื่อผู้เล่นหรือปาร์ตี้ในทีมใช้สกิลหรือความสามารถพิเศษต่างๆแล้ว ผู้เล่นจะต้องรอเวลาคูลดาวน์ถึงจะสามารถใช้สกิลใหม่ได้อีกครั้ง ระยะเวลาในการรอคูลดาวน์ขึ้นอยู่กับแต่ละสกิลและการอัพเกรด
ค่าพลังสีฟ้าของผู้เล่นคือค่าเกราะป้องกัน(Shield)ส่วนค่าพลังสีแดงคือค่าดาเมจหลักผู้เล่น(health) หากค่าพลังสีแดงหมดผู้เล่นจะตายทันที เมื่อทำการคัฟเวอร์หลบตามจุดกำบังต่างๆค่าพลังเกราะไบโอติกสีฟ้าจะฟื้นฟูอัตโนมัติ แต่ค่าพลังหลักสีแดงจะลดลงเรื่อยๆเมื่อไม่มีเกราะชิลด์ ต้องใช้ไอเท็มเมดิ-เจล(Medi-Gel)ในการฟื้นฟูค่าพลังสีแดงให้เต็ม เมดิ-เจลสามารถใช้เพื่อชุบชีวิตเพื่อนในทีมที่ล้มขณะต่อสู้ได้เช่นกัน
ส่วนของศัตรูแถบค่าพลังจะเหมือนผู้เล่น แต่ศัตรูบางตัวอาจมีค่าสีเหลืองคือค่าชุดเกราะสวมใส่เพิ่มเติม(Armor) ต้องโจมตีทั้งค่าเกราะสีฟ้า(Shield)และสีเหลือง(Armor)ให้หมดก่อน ถึงจะสามารถโจมตีทำดาเมจค่าสีแดง(health)จนศัตรูตายได้
- การเดินทางในดันเจี้ยนภารกิจจะไม่มีแผนที่ให้เปิดใช้งาน สิ่งที่มีก็เพียงพิกัดชี้ตำแหน่งไปที่จุดเป้าหมายของภารกิจเท่านั้น(Objective) หากต้องการสำรวจค้นหาเงินหรือไอเท็มต่างๆผู้เล่นจะต้องสำรวจด้วยตัวเอง

- อาวุธ, ชุดเกราะ, ไอเท็ม และ เฟอร์นิเจอร์ตกแต่งต่างๆ สามารถรับได้ด้วยการซื้อกับร้านค้าต่างๆในเกม(ยานนอร์มังดีที่ชั้น 5 Shuttle Bay ได้รวบรวมร้านค้าไว้ทั้งหมด เพื่อความสะดวกในการซื้อ) หรือการสำรวจไอเท็มภายในดันเจี้ยนภารกิจ
- ระบบแผนที่กาแล็กซี่(Map) การดำเนินเนื้อเรื่องของเกมจะเป็นโลกอิสระสามารถเลือกทำภารกิจใดก่อนก็ได้ โดยใช้ยานนอร์มังดี(Normandy SR-2)เป็นตำแหน่งเลือกพิกัดภารกิจต่างๆในแผนที่ เริ่มด้วยเลือกกลุ่มดาวในกาแล็กซี่> จากนั้นเลือกระบบสุริยะของกลุ่มดาว> แล้วเลือกดวงดาวหรือจุดหมายที่จะทำภารกิจ
ในทุกๆระบบกลุ่มดาวจะมีแมสส์ รีเลย์(Mass Relay)หนึ่งตัวในการใช้เลือกเปลี่ยนกลุ่มดาว ระหว่างการขับยานนอร์มังดีช่วงเลือกระบบสุริยะภายในกลุ่มดาวนั้นๆ จะต้องใช้เชื้อเพลิงในการไปที่จุดหมาย ผู้เล่นสามารถซื้อเชื้อเพลิงด้วยสกุลเงินในเกมได้ที่สถานีคลังเชื้อเพลิง(Fuel Depot) ซึ่งจะอยู่บริเวณใกล้กับแมสส์ รีเลย์ แต่สถานีคลังเชื้อเพลิงจะมีเพียงแค่บางกลุ่มดาวเท่านั้น
- การสำรวจดวงดาวต่างๆเพื่อทำเควสต์หรือหาทรัพยากรการทำสงคราม(War Asset) วิธีการสำรวจให้บินยานนอร์มังดีรอบๆระบบสุริยะ สแกนหาตำแหน่งของเควสต์หรือดาวต่างๆ(อาจมีรีฟเปอร์เข้ามาขับไล่ให้บินออกนอกระบบสุริยะแล้วกลับเข้ามาใหม่ หรือถ้าโดนรีฟเปอร์จับได้ ผู้เล่นจะกลับเข้ามาใหม่เองแบบโหลดบันทึกเกมอัตโนมัติล่าสุด) เมื่อตรวจพบสิ่งที่กำลังค้นหาจะมีสัญลักษณ์สีแดงกำกับบริเวณ เข้าไปดาวที่มีสัญญาณการตรวจพบแล้วสแกนดวงดาวเพื่อติดตั้งโพรบ(Probe) ช่วงที่สแกนดวงดาวหาตำแหน่งติดตั้งโพรบ ให้สังเกตเข็มสีขาวในเรดาร์สแกนเข็มนั้นจะชี้ไปจุดพิกัดติดตั้งโพรบที่ถูกต้อง

- ศัตรูหลักภายในเกมจะแบ่งเป็น 2 กลุ่มประเภทใหญ่ๆคือ
รีฟเปอร์(Reaper) กองทัพรีฟเปอร์เป็นเครื่องจักรเทคโนโลยีขั้นสูง พวกมันจำศีลอาศัยอยู่ที่จุดมืดมิดของเอกภพ รอเวลากลับเข้ามาในกาแล็กซี่เพื่อทำลายเก็บเกี่ยวสิ่งมีชีวิตทั้งหมด รีฟเปอร์ได้นำสิ่งมีชีวิตสายพันธ์ุต่างๆมาปรับแต่งผสมกับเทคโนโลยีของตัวเอง เพื่อการควบคุมและสั่งให้กระทำตามจำนงค์ของกองทัพรีฟเปอร์ จนได้เป็นศัตรูชนิดต่างๆที่ผู้เล่นจะได้ต่อสู้ด้วยเช่น แบนชี(Banshee), บรู๊ต(Brute), ฮาร์เวสเตอร์(Harvester) หรือ ศัตรูประเภทฮัสค์(Husk)ชนิดต่างๆของเกมส์ในภาคเก่า
เซอร์เบอรัส(Cerberus) เซอร์เบอรัสเป็นองค์กรกองทัพทหารและนักวิจัยวิทยาศาสตร์ที่ต้องการเป็นศูนย์กลางของกาแล็กซี่ ด้วยปรัชญาการกระทำใดๆของมนุษย์ในกาแล็กซี่ เป็นการกระทำด้วยความความสุจริต และเผ่าพันธุ์อื่นๆต้องยอมรับในวิวัฒนาการของสายพันธ์ุมนุษย์ เซอร์เบอรัสนำเอาเศษซากเทคโนโลยีต่างๆของรีฟเปอร์ มาพัฒนาและปรับปรุงให้มนุษย์มีความสามารถเกินขีดจำกัด และจะเป็นศัตรูของผู้เล่นตลอดทั้งเกมเช่น แอสเซาท์ ทรูปเปอร์Assault Trooper), แอตลาส(Atlas), คอมแบท เอ็นจิเนียร์(Combat Engineer) และ แรมพาร์ท เมค(Rampart Mech)ฯ
- บทสนทนาต่างๆภายในเกมจะส่งผลกระทบต่อเนื้อเรื่องของเกมในอนาคต ค่าเสน่หาจะช่วยเพิ่มตัวเลือกของประโยคสนทนา เพื่อให้ผลลัพธ์ของเรื่องราวดำเนินไปตามที่ผู้เล่นต้องการ ควรหมั่นเซฟเกมหลายๆจุดเมื่อผิดพลาดในการเลือกประโยคสนทนา ให้โหลดบันทึกลองเปลี่ยนประโยคสนทนาจนกว่าผู้เล่นจะพอใจ และในหลายๆบางคัตซีนช่วงบทสนทนาจะมีการกดปุ่มคำสั่งแบบควิกไทม์อีเว้นท์ ควรตั้งสมาธิในช่วงคัตซีนเล่นให้ดีและกดปุ่มให้ทันเวลาเพื่อเพิ่มค่าศีลธรรมให้ตัวละคร

เฉลยเกมส์
บทนำ
เหตุการณ์ในแมสส์ เอฟเฟคต์เกิดขึ้นที่จักรวาลเอกภพในปี ค.ศ.2183(ภาคแรก) โดยที่การเดินทางข้ามระหว่างดวงดาวได้ใช้อุปกรณ์ขนส่งมวลสารที่เรียกว่าแมสส์ รีเลย์ส(Mass Relays) ซึ่งเป็นเทคโนโลยีที่เชื่อกันว่าสร้างขึ้นโดยเผ่าพันธุ์เอเลี่ยนที่สูญพันธุ์ไปแล้ว รู้จักกันในชื่อชาวโพรเธี่ยนส์(Protheans) 
รัฐบาลของเอกภพในนามสภาซิทาเดล(Citadel Council)ได้ปกครองควบคุมดูแลกาแล็กซี่ โดยมีหน้าที่รับผิดชอบในการรักษากฎหมายและความสงบเรียบร้อย ให้กับทุกเผ่าพันธุ์เชื้อชาติต่างๆที่เข้าร่วมเป็นสมาชิกกับสภา
ฝ่ายเครือข่ายพันธมิตร(Systems Alliance)ซึ่งจัดตั้งขึ้นในปี ค.ศ.2157 เป็นองค์กรตัวแทนของมนุษยชาติเพื่อเข้าร่วมกับสภาซิทาเดล ได้ส่งผู้บัญชาการเชพเพิร์ด(Commander Shepard)ผู้สําเร็จหลักสูตรจากโครงการกองกําลังพิเศษของมนุษยชาติ ไปปฏิบัติหน้าที่ปกป้องกาแล็กซี่ร่วมกับกองทัพของสภาซิทาเดล เชพเพิร์ดเป็นมนุษย์คนแรกที่สมัครขอเข้าร่วมกองกําลังยุทธวิธีและการลาดตระเวนพิเศษ(Spectre)ของสภาซิทาเดล

แมสส์ เอฟเฟคต์ 3 เรื่องราวดำเนินอยู่ในปี ค.ศ.2186 หรือหลังจากเหตุการณ์ในภาคที่ 2 หกเดือน ประชากรทั่วกาแล็กซี่ใช้ชีวิตด้วยความยากลำบาก จากความกลัวต่อการรุกรานจากสายพันธุ์สังเคราะห์ที่ผสมรวมกับสิ่งมีชีวิต(Synthetic-Organic) ที่กองทัพรีฟเปอร์สร้างขึ้นมาเพื่อเก็บเกี่ยวสิ่งมีชีวิตในกาแล็กซี่ เมื่อครบกำหนดทุกๆ 50,000 ปี
สถานการณ์ของเผ่าพันธุ์ชาวโครแกน(Krogan)กำลังเผชิญกับการสูญพันธุ์ จากอาวุธชีวภาพจีโนเฟจ(Genophage) ซึ่งถูกพัฒนาวิจัยโดยชาวซาลาเรี่ยนส์(Salarians) และกองทัพชาวทูเรี่ยนส์(Turians)ได้นำไปใช้ในสงคราม"กบฏนักรบโครแกน"
ชาวควอเรี่ยนส์(Quarians)ที่อยู่ในกองยานอพยพ เตรียมความพร้อมในการบุกยึดดาวบ้านเกิดคืนจากกองทัพหุ่นยนต์เกธ(Geth) ที่พวกเขาได้สร้างกองทัพเกธขึ้นมาเอง แต่สุดท้ายก็เป็นกองทัพเกธที่รุกรานเผ่าพันธุ์ควอเรี่ยนส์ผู้สร้างของตน
องค์กรเซอร์เบอรัส(Cerberus)ของอิลลูซีฟแมน(Illusive Man) ที่นับถือลัทธิเชิดชูมนุษย์กำลังรวบรวมกองกำลังครั้งใหม่ เพื่อปกป้องเผ่าพันธุ์มนุษย์จากวัฏจักรล้างบางของกองทัพรีฟเปอร์ ภายหลังจากที่ได้ร่วมมือกับเชพเพิร์ด(Shepard หรือตัวละครหลักผู้เล่น)ในปฏิบัติการเฉพาะกิจปราบกองทัพคอลเล็คเตอร์
เชพเพิร์ดกำลังถูกพักราชการและรอการไตร่สวนจากศาลทหารในเหตุการณ์ที่เกิดขึ้น ของเครือข่ายพันธมิตร(Systems Alliance)ที่ดาวโลก...

อารัมภบท(Prologue)
- โปรล๊อก: เอิร์ธ(Prologue: Earth) ที่ดาวโลกเชพเพิร์ดกำลังโดนควบคุมตัวจากเครือข่ายพันธมิตร เจมส์(James Vega)และอดีตผู้บัญชาการของเชพเพิร์ดนายพลฯแอนเดอร์สัน(David Anderson)ได้เข้ามาพบ ก่อนที่เชพเพิร์ดจะต้องไปให้ปากคำในการพิจารณาสถานการณ์กับทางสภาเครือข่ายพันธมิตร ระหว่างไปห้องพิจารณาเชพเพิร์ดจะพบกับอีกหนึ่งตัวละครแอชลี่ย์(Ashley Williams หรือตัวละครที่ผู้เล่นสร้างความสัมพันธ์ไว้ในภาคเก่า) ในขณะที่เชพเพิร์ดกำลังให้ข้อมูลต่างๆกับสภาเครือข่ายพันธมิตร กองทัพรีฟเปอร์(Reaper)ได้บุกมายังโลกมนุษย์และโจมตีเครือข่ายพันธมิตร เชพเพิร์ดกับแอนเดอร์สันจึงต้องรีบหนีออกจากพื้นที่ที่ถูกโจมตี
เมื่อบังคับตัวละครได้ให้เรียนรู้วิธีการเล่นเบื้องต้นตามที่เกมแนะนำแล้วตามแอนเดอร์สันไป(การดูพิกัดจุดหมายภารกิจ, การวิ่ง, การกระโดดข้ามเส้นทางตัดขาด, การหลบกำบังคัฟเวอร์, การกระโดดข้ามไปด้านหน้าจากที่กำบัง, การใช้อาวุธปืน, การต่อสู้ระยะประชิด Melee Combat, การเก็บเสบียงทั้งกระสุนอาวุธและชุดปฐมพยาบาล Medi-Gel และในภาคที่ 3 สามารถกระโดดม้วนตัวขณะกำลังต่อสู้ เพื่อหลบเลี่ยงการถูกโจมตีในระยะประชิดจากศัตรูได้)

กำจัดศัตรูตามเส้นทางไปที่แครช ไซต์เก็บปืนไรเฟิลจู่โจมและสำรวจวิทยุ ตอนนี้จะต้องกำจัดคานนิบัล(Cannibal)ที่ออกมาเรื่อยๆ จนกว่ากระสุนปืนทุกกระบอกจะหมด จากนั้นยานนอร์มังดี เอสอาร์-2(Normandy SR-2)จะบินเข้ามาช่วยและรับเชพเพิร์ดขึ้นยาน
แอนเดอร์สันจะสั่งลากับเชพเพิร์ดว่าให้ไปขอความช่วยเหลือจากสภาซิทาเดล(Citadel) ส่วนตัวเขาจะรอและต่อต้านพวกรีฟเปอร์กับกองกำลังเครือข่ายพันธมิตรอยู่ที่โลก
บนยานนอร์มังดีพลเรือเอกแฮคเก็ทต์(Admiral Hackett)ผู้บัญชาการกองยานเครือข่ายพันธมิตร จะติดต่อหาเชพเพิร์ดเพื่อวางแผนยุติสงครามกับเครื่องจักร และกอบกู้จักรวาลทางช้างเผือกอีกครั้ง...

- ไพรออริตี้: มาร์ส(Priority: Mars) แฮคเก็ทต์ได้มอบหมายภารกิจให้ยานนอร์มังดีไปสถานีวิจัยที่ดาวอังคาร ภายหลังจากที่กองยานพันธมิตรไม่สามารถติดต่อกับทีมวิจัยของที่นั่นได้ เพื่อตรวจสอบข้อมูลอารยธรรมของชาวโพรเธี่ยนส์ ซึ่งคาดว่าเป็นข้อมูลสำคัญที่สามารถเอาชนะกองทัพรีฟเปอร์ได้
เมื่อมาถึงดาวอังคารเชพเพิร์ดจะได้เจมส์และแอชลี่ย์เป็นเพื่อนปาร์ตี้ร่วมทีม เดินสำรวจไปตามเส้นทางของจุดหมายภารกิจเพื่อเข้าสถานีวิจัย เก็บอาวุธปืนไรเฟิลซุ่มยิงเรียนรู้วิธีการติดตั้งอาวุธและการเปลี่ยนอาวุธขณะต่อสู้ กำจัดทหารเซอร์เบอรัสที่บุกมาถึงสถานีวิจัยก่อนทีมของเชพเพิร์ด(หากเพื่อนร่วมทีมล้มขณะต่อสู้ให้ใช้เมดิ-เจลชุบชีวิต หรือวิ่งไปใกล้เพื่อนที่ล้มแล้วกดปุ่มช่วยชีวิตRevive) สำรวจสวิตช์ลิฟต์ที่สุดทางเพื่อเข้าไปที่ด้านในของสถานีวิจัย
ในสถานีวิจัยจะพบลิอาร่า(Dr. Liara T'Soni อดีตเพื่อนร่วมทีมเชพเพิร์ดในภาคที่ 1)กำลังต่อสู้กับผู้บุกรุก ลิอาร่าจะเข้าร่วมปาร์ตี้แทนเจมส์จัดเตรียมทีมให้เรียบร้อย แล้วกำจัดกองทัพเซอร์เบอรัสรอบบริเวณให้หมด จะมีการแนะนำการติดตั้งสกิลของทุกคนในปาร์ตี้และการใช้สกิล พอเคลียร์ศัตรูแล้วสำรวจสวิตช์เครนเพื่อยกรถยนต์ขึ้น จากนั้นขึ้นไปบนลังกล่องใกล้ๆรถแล้ววิ่งกระโดดเข้าประตูสุดทางที่ชั้นบน

ลุยศัตรูไปตามเป้าหมายภารกิจสำรวจแผงคอนโซลควบคุมที่ด่านรักษาความปลอดภัย ออกจากนอกสถานีเพื่อข้ามไปอีกฝั่งบริเวณโรงอาหาร เคลียร์ทหารเซอร์เบอรัสและสำรวจแผงควบคุมด่านรักษาความปลอดภัยจุดที่สอง ตอนนี้เป้าหมายหลักของเราคือโซนรถรางขนส่งเพื่อเข้าไปพื้นที่งานวิจัยชาวโพรเธี่ยนส์
เดินทางฝ่าศัตรูหากพบทหารการ์เดี้ยน(Guardian)ที่ถือโล่ป้องกัน ควรใช้ระเบิดมือโจมตีเพื่อให้มันเปิดโล่ออก หรือใช้สกิลประเภทหยุดชะงัก, ยกศัตรูขึ้น เพื่อให้ยิงกำจัดการ์เดี้ยนในจุดที่ไม่มีโล่ป้องกัน บริเวณห้องฆ่าเชื้อผู้เล่นต้องสำรวจแท่นควบคุมหน้าห้อง ให้พื้นที่เลเซอร์สแกนเป็นเส้นตรงกับประตูด้านขวาที่เราจะเดินผ่านให้พอดี
ในพื้นที่ถัดมาจะมีป้อมปืนอัตโนมัติที่คอยระดมยิงใส่ทีมของเราตลอด ให้หลบกำบังตามจุดคัฟเวอร์ แล้วรอจังหวะในการเปลี่ยนจุดคัฟเวอร์ไปที่ด้านหน้าในตอนที่ป้อมปืนหยุดยิง หลบคัฟเวอร์ไปจนถึงห้องควบคุมป้อมปืนที่ด้านในแล้วสำรวจปิดระบบป้อมปืน จากนั้นจะมีทหารเซอร์เบอรัสบุกเข้ามาอีกหนึ่งชุด เราจะต้องกำหนดแท็คติกให้เพื่อนร่วมทีมสแตนบายยืนในจุดตามที่เกมกำหนด เมื่อจัดการศัตรูแล้วสำรวจสวิตช์รถรางเพื่อเดินทางไปข้างใน แต่รถรางจะโดนโจมตีจนขัดข้องให้กำจัดทหารเซอร์เบอรัสอีกขบวนหนึ่ง แล้วกระโดดข้ามไปที่ขบวนของศัตรูสำรวจสวิตช์เพื่อเดินทางต่อ

เมื่อเดินทางไปถึงโซนวิจัยจะพบหอจดหมายเหตุของชาวโพรเธี่ยนส์ ในขณะที่ทีมเชพเพิร์ดกำลังตรวจสอบความเสียหายที่เกิดขึ้น อิลลูซีฟแมน(Illusive Man ตัวละครหลักในภาค 2 ที่ได้ฟื้นคืนชีวิตให้เชพเพิร์ด และร่วมมือกันกำจัดกองทัพคอลเล็คเตอร์ Collector)ปรากฏตัวขึ้นด้วยภาพโฮโลแกรมมีบทสนทนากับเชพเพิร์ด ในเวลาเดียวกันอีวา(Eva)หุ่นดรอยด์แทรกซึมของเซอร์เบอรัส ได้เจาะระบบและดึงข้อมูลจากหอจดหมายเหตุออกมา ก่อนที่อีวาจะรีบวิ่งหนีออกจากสถานีวิจัย
ให้รีบวิ่งตามอีวาไปเรื่อยๆอย่าให้ระยะห่างของการไล่ตามห่างมากจนเกินไป ไม่ต้องสนใจพวกทหารเซอร์เบอรัสที่ออกมาขัดขวางวิ่งตามอีวาอย่างเดียว จะมีคัตซีนที่อีวากำลังขึ้นยานหลบหนีแต่ยานลำเลียงของเจมส์ได้ชนหยุดอีวาได้ทัน แอชลี่ย์ได้เข้าไปตรวจสอบซากยานของอีวา ร่างไซบอร์กซินเธติกของอีวาได้เข้าโจมตีแอชลี่ย์จนเธอหมดสติ และอีวากำลังจะพุ่งเข้ามาโจมตีเชพเพิร์ด ให้รีบยิงอีวาให้ล้มก่อนอีวาจะมาถึงตัวละครของผู้เล่น เมื่อสถานการณ์สงบทุกคนและร่างหุ่นของอีวาได้กลับขึ้นไปที่ยานนอร์มังดี
เชพเพิร์ดจะรายงานเหตุการณ์กับเเฮคเก็ทต์พร้อมกับข้อมูลครูซิเบิ้ล(Crucible) อุปกรณ์เครื่องมือพิมพ์เขียวของชาวโพรเธี่ยนส์ ที่ในอดีตไม่เคยมีใครสร้างอาวุธชิ้นนี้ มาทำลายโครงข่ายเทคโนโลยีของรีฟเปอร์ได้สำเร็จเลย

- ไพรออริตี้: เดอะ ซิทาเดล 1(Priority: The Citadel I) เชพเพิร์ดได้เดินทางไปที่สถานีซิทาเดลเพื่อรายงานสถานการณ์ ต่อเอกอัครราชทูตอูดิน่า(Donnel Udina)สมาชิกของสภา เกี่ยวกับภัยคุกคามของกองทัพรีฟเปอร์ที่ได้รุกรานเข้ามาในโลก รวมถึงแบบพิมพ์เขียวเครื่องมืออุปกรณ์ของชาวโพรเธี่ยนส์ที่อาจหยุดสงครามได้ เพื่อให้อูดิน่าโน้มน้าวให้สภาซิทาเดลสนับสนุนและเข้าร่วมในแผนของเครือข่ายพันธมิตร ในการยุติความขัดแย้งระหว่างเครื่องจักรและสิ่งมีชีวิตบนกาแล็กซี่
ในซิทาเดลผู้เล่นสามารถเดินสำรวจพื้นที่ต่างๆได้อย่างอิสระ เพื่อตรวจสอบร้านค้าไอเท็ม, ข้อมูลภารกิจของหน่วยสเปคเตอร์, พูดคุยกับเพื่อนร่วมทีมเพื่อสร้างความสัมพันธ์, สนทนากับเอ็นพีซีทำเควสต์รอง โดยในซิทาเดลจะมีแผนที่และเป้าหมายตัวละครคนสำคัญระบุในแผนที่อย่างชัดเจน(แต่บางเควสต์อาจไม่ระบุพิกัดอะไรเลย เพียงแค่เดินผ่านๆเควสต์จะเด้งให้แบบอัตโนมัติ และบางเควสต์มีความต่อเนื่องจากภารกิจหลักและระยะการจบเควสต์ที่จำกัด จึงอาจมีการเปลี่ยนแปลงการระบุตำแหน่งของตัวละครเอ็นพีซี ภายในแผนที่ที่ไม่แน่นอน) เควสต์ย่อยภารกิจรองต่างๆหากทำสำเร็จ จะเพิ่มค่าทรัพยากรสงคราม(War Asset)ซึ่งจะมีผลต่อช่วงท้ายเกมอีกด้วย

 ในช่วงเริ่มต้นของเกมอาจยังไม่มีพื้นที่ให้เดินเล่นในซิทาเดลมากนัก หลังจากเยี่ยมแอชลี่ย์ที่บาดเจ็บในชั้นโรงพยาบาลเสร็จ ให้สำรวจลิฟต์ไปพบอูดิน่าที่ออฟฟิศทำงานในชั้นซิทาเดล แอมบาสซี่ส์(Citadel Embassies)
เชพเพิร์ดและลิอาร่าจะรายงานสถานการณ์การรุกรานของรีฟเปอร์ให้สภาซิทาเดลรับทราบ แต่ทางสภาไม่มีความเชื่อมั่นในอุปกรณ์ของชาวโพรเธี่ยนส์ที่จะหยุดยั้งรีฟเปอร์ได้ จึงไม่ให้ความช่วยเหลือกับฝ่ายเครือข่ายพันธมิตรในการก่อสร้างเครื่องมือนี้ และสถานการณ์การบุกโจมตีดาวโลกของฝ่ายกองทัพรีฟเปอร์ สภาซิทาเดลก็งดให้การสนับสนุนกับเครือข่ายพันธมิตรเช่นกัน เนื่องจากหลายพื้นที่ในกาแล็กซี่กำลังอยู่ในสภาวะสงคราม สมาชิกเผ่าพันธุ์ต่างๆที่เป็นสมาชิกกับสภาซิทาเดลตอนนี้ก็ตกอยู่ในความเสี่ยงเหมือนดาวโลก เมื่อจบการประชุมสมาชิกสภาชาวทูเรี่ยนส์จะเข้ามาพูดคุยกับเชพเพิร์ด เกี่ยวกับสงครามของชาวทูเรี่ยนส์ที่ดาวพาลาเวน พอทำอะไรต่างๆในซิทาเดลเรียบร้อยแล้ว สำรวจลิฟต์เลือกชั้นท่าเทียบยาน เบย์ ดี-24เพื่อกลับยานนอร์มังดี

บนยานนอร์มังดีเมื่อบังคับตัวละครได้ให้เดินสำรวจรอบๆยาน และสนทนากับลูกเรือหรือลูกทีมให้คุ้นเคย เพราะเราจะมีอะไรให้ทำภายในยานลำนี้กับสถานีซิทาเดลตลอดทั้งเกม
ในนอร์มังดีจะประกอบด้วยห้าพื้นที่จำนวนห้าชั้นของยาน ชั้น 1 ห้องพักเชพเพิร์ด(Captain's Cabin) ห้องนอนของเชพเพิร์ดที่ควรหมั่นมาเช็คข้อความ เพื่อเรียกลูกเรือมาสารสัมพันธ์ในห้องพักของเชพเพิร์ด
ชั้น 2 ศูนย์ข้อมูลปฏิบัติการ(Combat Information Center) พื้นที่หลักในการเลือกทำภารกิจในกาแล็กซี่แม็พ, ห้องวอร์รูมในการเช็คทรัพยากรสงคราม และ ห้องสื่อสารเพื่อรับข้อมูลของภารกิจและการติดต่อจากบุคคลสำคัญ
ชั้น 3 โซนลูกเรือ(Crew Deck) จุดที่สำคัญคือห้องพยาบาลและห้องพักลิอาร่า ห้องพยาบาลที่สามารถเลือกเปลี่ยนหรือเพิ่มสกิลใหม่ที่ไม่มีในคลาสอาชีพที่เลือกได้ ห้องลิอาร่าสามารถเพิ่มค่าอบิลิตี้ต่างๆหลังจากทำภารกิจหลักสำเร็จได้
ชั้น 4 โซนวิศวกรรมเครื่องยนต์(Engineering) นอกจากเป็นพื้นที่พักของลูกเรือภายในเกมแล้ว ก็ไม่มีความสำคัญอะไรมาก
ชั้น 5 ลานประตูใหญ่ท้ายยาน(Shuttle Bay) เป็นพื้นที่ปรับแต่งอัพเกรดอาวุธและชุดเกราะให้ตัวละคร สามารถซื้อไอเท็มที่ขายอยู่ในสถานีซิทาเดลทั้งหมด ในชั้นชัตเตอร์ เบย์ได้

องก์ที่ 1(Act I)
- ไพรออริตี้: พาลาเวน(Priority: Palaven) ไพรมาร์ช เฟโดเรี่ยน(Primarch Fedorian)ชาวทูเรี่ยนลำดับชั้นบัญชาการ ได้รวบรวมกองทัพทูเรี่ยนส์ทำข้อตกลงในการเข้าร่วมสงครามกับเครือข่ายพันธมิตร รวมถึงให้ความช่วยเหลือกับพันธมิตรในการสร้างครูซิเบิ้ล แต่สถานการณ์ของเฟโดเรี่ยนเขาถูกรุกโจมตีอย่างหนักโดยฝ่ายรีฟเปอร์ที่ดาวพาลาเวน เชพเพิร์ดจึงต้องรีบไปช่วยเฟโดเรี่ยน เพื่อไม่ให้พลาดโอกาสในการรวบรวมกองกำลังหยุดยั้งกองทัพรีฟเปอร์ (Apien Crest>Trebia>Menae)
เมื่อเดินทางมาถึงดาวเมเน(Menae)บริวารของดาวพาลาเวนให้เคลียร์ฝูงฮัสค์ แล้วเข้าไปในแคมป์ค่ายพักของทหารทูเรี่ยนส์พูดคุยกับหัวหน้ากองบังคับการ เชพเพิร์ดจะทราบว่าเฟโดเรี่ยนเสียชีวิตไปแล้ว ตอนนี้เชพเพิร์ดจะต้องช่วยซ่อมแซมเสาสื่อสารของแคมป์นี้ เพื่อติดต่อกับศูนย์บัญชาการที่ดาวพาลาเวนก่อน ออกไปที่ด้านนอกแคมป์ไม่ไกลมากกำจัดฝูงฮัสค์ สำรวจที่เสาวิทยุให้ลูกทีมหนึ่งคนซ่อมแซมเสาสื่อสาร และต้านศัตรูที่บุกเข้ามาเรื่อยๆแล้วคุ้มครองเสาสัญญาณจนกว่าศัตรูจะหมด กลับไปที่แคมป์พูดคุยกับหัวหน้ากองบังคับการอีกครั้ง

ในขณะที่กำลังสนทนาเรื่องไพรมาร์ชคนใหม่ตัวละครร่วมเป็นร่วมตายก็ปรากฏตัวออกมา เขาคือ...ไอออนแมน! เอ้ย!..ไม่ใช่ การ์รัส(Garrus ตัวละครหลักของแฟรนไชส์อีกหนึ่งคน) เวลาเดียวกันนักบินยานนอร์มังดีโจ๊กเกอร์(Joker)ก็ติดต่อถึงเชพเพิร์ดถึงปัญหาความขัดข้องด้านการบิน ตอนนี้การ์รัสจะเข้าร่วมทีมกับเราเตรียมอาวุธสกิลให้การ์รัสแล้วออกไปที่ลานบินนอกแคมป์ กำจัดฝูงฮัสค์และศัตรูรอบลานบินให้หมดแล้วกลับไปที่ป้อมปืนภายในแคมป์
ปีนบันไดไปควบคุมป้อมปืนบาร์ริเคดยิงต้านศัตรูที่บุกเข้ามาเรื่อยๆ เชพเพิร์ดจะพลาดตกจากป้อมปืนลงไปที่กลางดงของศัตรู และเจอบรู๊ต(Brute)เป็นศัตรูที่มีค่าชุดเกราะสูงมากของเกมนี้ อาวุธหนักๆประเภทปืนลูกซองระเบิดมือหรือสกิลตูมตาม จะใช้ได้ดีในการกำจัดมัน พยายามรักษาระยะห่างกับบรู๊ตอย่าเข้าใกล้หรือไกลมากเกินไป ไกลมากปืนผู้เล่นทำดาเมจไม่ดี ใกล้มากจะหลบการโจมตีของบรู๊ตยาก หากถูกมันเข้าโจมตีระยะประชิดให้ตัวละครของผู้เล่นใช้การกระโดดกลิ้ง จะสามารถหลบการโจมตีของบรู๊ตได้ พอเคลียร์ศัตรูเรียบร้อยแล้วเชพเพิร์ดจะต้องเดินไปพบไพรมาร์ชคนใหม่ นายพลวิคตัส(General Victus)

เมื่อไปถึงแคมป์ค่ายของวิคตัสจะต้องจัดการศัตรูมากมาย ระวังเพียงแค่เจ้าบรู๊ตที่จะออกมาประมาณ 3-4 ตัว ตีฝ่าศัตรูเข้าไปให้ใกล้เต็นท์ของวิคตัสแล้วจะพบคัตซีน เชพเพิร์ดจะแจ้งวิคตัสเกี่ยวกับสถานะใหม่ของเขาในชนชั้นชาวทูเรี่ยนส์(ไพรมาร์ชของทูเรี่ยนเปรียบเสมือนฐานะกษัตริย์แม่ทัพ ผู้สั่งการสูงสุดในลำดับชั้น) วิคตัสจะสั่งลากองทัพแนวหน้าของเขาก่อนที่จะเข้าร่วมกับฝ่ายเครือข่ายพันธมิตร
ที่ยานนอร์มังดีไปที่ชั้น 3 ห้องพยาบาลจะพบคัตซีนที่ปัญญาประดิษฐ์ของยานอีดี้(EDI) ได้ใช้ร่างไซบอร์กซินเธติกของอีวาเป็นร่างกายของระบบเอไอของเธอ(ตรรกะประมาณจาร์วิสใช้ร่างวิชั่น เหมือนในจักรวาลมาร์เวล) เราจะได้อีดี้เป็นสมาชิกร่วมในปาร์ตี้ทีมอีกหนึ่งคน
ช่วงนี้หากต้องการออกสำรวจหาทรัพยากรสงครามไอเท็มอัพเกรดต่างๆ หรือ ทำภารกิจเควสต์รอง เมื่อกลับไปบนนอร์มังดีเปิดกาแล็กซี่แม็พแล้วออกสำรวจได้เลยครับ..

- ไพรออริตี้: ซูร์เคช(Priority: Sur'Kesh) มุ่งหน้าไปที่ยานดิพโลเมติค(Annos Basin>Pranas>Diplomatic Ships) จะมีการประชุมเกี่ยวกับสถานการณ์การรุกรานของกองทัพรีฟเปอร์ ดาลาทรัสส์(Dalatrass Linron)ผู้นำของเผ่าพันธุ์ซาลาเรี่ยนส์, วิคตัสผู้นำสายพันธุ์ทูเรี่ยนส์ และ เร็กซ์(Wrex)อดีตเพื่อนทีมในยานนอร์มังดีรุ่นบุกเบิก ตัวแทนของนักรบโครแกน ทั้งหมดได้หารือรวมถึงคิดวิธีแก้ปัญหาของความโกลาหลนี้
เชพเพิร์ดได้ขอความช่วยเหลือจากชาวโครแกน(Krogan)ในการทำสงครามกับรีฟเปอร์ เพียงแต่ก่อนที่พวกนักรบโครแกนจะร่วมมือกับฝ่ายเครือข่ายพันธมิตรนั้น พวกเขาต้องการรักษาเชื้อไวรัสทางพันธุกรรม"จีโนเฟจ"ซ่ะก่อน(Genophage) เชพเพิร์ดต้องเดินทางไปที่ดาวซูร์เคชของชาวซาลาเรี่ยนส์(Salarian) เพื่อปกป้องชาวโครแกนเพศหญิงที่ถือว่าเป็นกุญแจสำคัญในการรักษาโรคนี้
ทีมเชพเพิร์ดและเร็กซ์จะลงไปที่ดาวซูร์เคช และได้รับการต้อนรับที่ไม่อบอุ่นจากชาวซาลาเรี่ยนส์ พูดคุยกับผู้ดูแลของที่นี่รอบพื้นที่แล้วสำรวจลิฟต์ไปที่ห้องวิจัย ในห้องวิจัยจะพบโครแกนเพศหญิงที่สามารถรักษาจีโนเฟจตามผลทดลองได้ และพบตัวละครเก่าจากเกมส์ภาคที่ 2 ที่ผู้เล่นสร้างความสัมพันธ์เอาไว้(บทสรุปนี้ของผมคือมอร์ดิน Mordin)

ในเวลาเดียวกันเร็กซ์ได้สื่อสารติดต่อกับเชพเพิร์ด ว่ากองทัพเซอร์เบอรัสได้บุกโจมตีสถาบันวิจัยแห่งนี้ จะให้โครแกนหญิงไปกับเชพเพิร์ดหรืออยู่ทดลองที่นี่ต่อก็ขึ้นกับการตัดสินใจของผู้เล่น ให้สำรวจลิฟต์กลับขึ้นชั้นบนแต่ทหารเซอร์เบอรัสได้บุกล้อมสถาบันไว้หมดแล้ว ปีนบันไดทางออกฉุกเฉินฝั่งตรงข้ามลิฟต์ขึ้นไปที่ชั้น 1 ลุยฝ่าศัตรูขึ้นบันไดที่สุดทางไปชั้นที่ 2 ในชั้นที่สองต้องรีบกำจัดพวกเซอร์เบอรัส เพราะพ็อดตู้รักษาความปลอดภัยโครแกนหญิงจะถูกโจมตี พอกำจัดศัตรูหมดแล้วสำรวจที่แผงควบคุมเพื่อให้พ็อดไปชั้นบนต่อ
ฝ่าศัตรูไปที่ชั้น 3 จะพบทหารวิศวกร(Cerberus Engineers)ที่ติดตั้งป้อมปืนเคลื่อนที่ ให้หาไอ้ตัวทหารวิศวกรชุดสีดำแล้วกำจัดพวกมันก่อน แล้วค่อยใช้ระเบิดหรือสกิลทำลายป้อมปืนเคลื่อนที่ ระมัดระวังป้อมปืนที่มีพลังค่าดาเมจสูงไว้ด้วย ในชั้นที่ 4 ต้องรีบเคลียร์ศัตรูให้หมดก่อนที่ค่าความเสียหายของตู้พ็อดจะหมด สำรวจฟื้นฟูพลังงานของอาคารที่ห้องด้านใน แล้วย้อนมาสำรวจแผงควบคุมที่หน้าตู้พ็อดจุดที่สองเพื่อเคลื่อนย้าย

ที่ชั้นบนสุดยังต้องปกป้องพ็อดของโครแกนหญิงจากศัตรูอีก เมื่อเคลียร์พื้นที่แล้วสำรวจแผงควบคุมจุดสุดท้ายแล้วเซอร์เบอรัสจะส่งหุ่นแอตลาส(Atlas)ลงมา การสู้กับแอตลาสพยายามอย่าเข้าใกล้มันมากหาจุดคัฟเวอร์หลบดีๆ ใช้อาวุธหนักๆเช่นไรเฟิลซุ่มยิง, ปืนลูกซอง หรือ ระเบิดมือและสกิลสายเจาะเกราะ โจมตีให้เกราะทั้งชิลด์และอาร์เมอร์ของแอตลาสแตกก็จะล้มมันได้ ระวังพวกทหารราบที่โจมตีใส่ตู้พ็อดโครแกนด้วย
จากนั้นเชพเพิร์ดจะกลับไปรายงานสถานการณ์กับแฮคเก็ทต์ที่ยานนอร์มังดี และรับทราบว่าตอนนี้เครือข่ายพันธมิตรได้เริ่มก่อสร้างอุปกรณ์ครูซิเบิ้ลแล้ว

- ไพรออริตี้: ทูชานก้า(Priority: Tuchanka) อีฟ(Eve โครแกนเพศหญิงที่เชพเพิร์ดไปคุ้มครอง)คือพันธุกรรมของโครแกน ที่สามารถรักษาไวรัสจีโนเฟจได้อย่างสมบูรณ์ แต่การสร้างแอนตี้ไวรัสเพื่อรักษาอาจต้องใช้เวลาทดลองอีกซักระยะ เมื่อทุกอย่างพร้อมสำหรับการรักษาให้ไปที่ดาวทูชานก้า(Krogan DMZ>Aralakh>Tuchanka)
***หากเควสต์ Priority: Tuchanka ไม่ปรากฏในกาแล็กซี่แม็พ ให้ลองทำเควสต์ภารกิจสั้นๆ 1-2 ภารกิจ จากนั้นจะมีภารกิจนี้แจ้งเตือนบนดาวทูชานก้า***
เริ่มภารกิจเชพเพิร์ดจะอยู่ในฮอลโลว์พื้นที่คล้ายลานประลองของชาวโครแกน กำจัดฝูงฮัสค์ที่เข้ามาจู่โจมผู้เล่น พอเคลียร์พื้นที่แล้วอีฟและเร็กซ์จะเข้ามาเจรจากับชาวโครแกน เพื่อเริ่มแผนการกระจายแอนตี้ไวรัสจีโนเฟจที่หอคอยเชราวด์(The Shroud)
ขณะที่ทุกคนกำลังมุ่งหน้าไปที่หอคอยเชราวด์ด้วยรถขนส่ง ได้เกิดอุปสรรคในการเดินทางและขบวนต้องหยุดรถเพื่อตรวจสอบ เมื่อเชพเพิร์ดลงจากรถแล้วให้สำรวจไอเท็มรอบๆและพูดคุยกับทหารโครแกน อีกด้านหนึ่งยานกองบินของฝ่ายพันธมิตรได้เริ่มบุกโจมตีรีฟเปอร์ที่เฝ้าหอคอย เชพเพิร์ดจะรีบสั่งให้ขบวนรถนำหน้าออกไปก่อน

ตอนนี้เชพเพิร์ดจะต้องเดินเท้าไปที่จุดนัดพบกับรถขนส่ง ให้ลุยฝ่าศัตรูตามเส้นทางของซากประหลักหักพังจนไปถึงรถขนส่งของอีฟ แล้วทุกคนจะเดินทางไปที่หอคอยต่อ
อีฟวางแผนให้คาลรอส(Kalros)สัตว์กินเนื้อประเภทเธรชเชอร์ มาว์ที่อาศัยอยู่ในใต้ดิน ออกมาโจมตีรีฟเปอร์ที่กำลังเฝ้าหอคอยเชราวด์ โดยการใช้วิธีตีค้อนโบราณเพื่อส่งสัญญาณเรียกคาลรอส
เมื่อทุกคนแยกย้ายไปทำหน้าที่ของตัวเองตามแผนที่วางไว้ เชพเพิร์ดจะมาอยู่บริเวณที่มีศัตรูล้อมพื้นที่กำจัดให้เรียบร้อย แล้วเดินเข้าไปหารีฟเปอร์ที่อยู่ด้านหน้า รีฟเปอร์จะยิงโจมตีเชพเพิร์ดขณะที่กำลังจะไปตีค้อนโบราณ ผู้เล่นจะต้องกดสำรวจค้อนเพื่อส่งสัญญาณทั้งสองจุด แต่ที่กลางลานที่จะไปตีค้อนส่งสัญญาณต้องสู้กับบรู๊ตจำนวน 4 ตัว หากมั่นใจว่าหลบบรู๊ตกับแขนของรีฟเปอร์ได้ ให้วิ่งไปสำรวจค้อนของทั้งสองฝั่งเลย หรือหากจะสู้กับบรู๊ตแม้มันจะโจมตีแรงและมีเกราะที่หนา แต่มันเป็นศัตรูที่ช้าและสามารถหาจังหวะกลิ้งหนีได้ ให้ค่อยๆกำจัดมันทีละตัวและอย่าอยู่ในพื้นที่แคบๆให้โดนบรู๊ตรุม(ใช้ลูกซอง,ระเบิดมือ,สกิลตูมตาม) เมื่อสำรวจค้อนครบทั้ง 2 ฝั่งคาลรอสจะออกมาทำลายรีฟเปอร์

เชพเพิร์ดจะเข้าไปที่หอคอยพบกับมอร์ดินและมีบทสนทนา(การดำเนินเนื้อเรื่องหลังจากนี้จะเป็นผลลัพธ์ ของความสัมพันธ์ตัวละครและการตัดสินใจต่างๆของผู้เล่นตั้งแต่ก่อนเริ่มภารกิจ) มอร์ดินเสียสละตัวเองขึ้นไปที่ชั้นบนแก้ไขให้หอคอยเชราวด์ กระจายแอนตี้ไวรัสเพื่อรักษาจีโนเฟจ และเชพเพิร์ดจะออกไปที่ด้านนอกของหอคอยก่อนที่หอคอยเชราวด์จะถล่มไปพร้อมกับมอร์ดิน ชาวโครแกนจะตอบแทนด้วยการเข้าร่วมสงครามกับฝ่ายเครือข่ายพันธมิตร
ในตอนนี้ชาวทูเรี่ยนส์และนักรบโครแกนได้ร่วมมือกันเป็นพันธมิตร ในช่วงเวลาที่การสังเคราะห์ยารักษาจีโนเฟจเสร็จสมบูรณ์ หลังจากที่ทั้งสองเผ่าพันธุ์ระหว่างทูเรี่ยนและโครแกน ได้สร้างสงครามกันเองมาเป็นเวลาช้านาน

องก์ที่ 2(Act II)
- ไพรออริตี้: เดอะ ซิทาเดล 2(Priority: The Citadel II) สมาชิกของสภาซิทาเดลชาวซาลาเรี่ยนได้ติดต่อถึงเชพเพิร์ด เขามีความกังวลเกี่ยวกับสมาชิกสภาฯอูดิน่า ว่าอูดิน่าอาจจะเป็นภัยคุกคามด้านความมั่นคงของสภาซิทาเดล ให้เชพเพิร์ดกลับสถานีซิทาเดล เพื่อปรึกษาเรื่องนี้กับสมาชิกสภาฯซาลาเรี่ยนเป็นการส่วนตัว (Serpent Nebula>Widow>Citadel)
ขณะที่ยานนอร์มังดีกำลังเข้าท่าเทียบยานในสถานีซิทาเดลก็ได้พบความผิดปกติ ก่อนที่จะพบการบุกโจมตีสถานีซิทาเดลโดยองค์กรเซอร์เบอรัส
เชพเพิร์ดจะมาอยู่บริเวณหน้าประตูโซนซี-เซคกำจัดทหารรอบๆบริเวณ พูดคุยกับเจ้าหน้าที่ไบลี่ย์เราจะเข้าไปในสถานีเพื่อช่วยสมาชิกสภาและคนที่รอดชีวิต ฝ่าศัตรูภายในออฟฟิศทำงานสำรวจแผงควบคุมที่จุดรักษาความปลอดภัยแล้วขึ้นลิฟต์ ออกจากลิฟต์ไปที่ห้องเอ็กซ์คิวเตอร์เพื่อช่วยสมาชิกสภา แต่สุดยอดมือสังหารของเซอร์เบอรัสจะโผล่ออกมาโจมตีสมาชิกสภา ไค เล้ง(Kai Leng)มีคัตซีนการต่อสู้ของฝ่ายผู้เล่นกับไค

หลังจากต่อสู้กับไค เชพเพิร์ดจะมาอยู่บริเวณรัฐสภาที่มีศัตรูกลุ่มแฟนท่อมส์(Phantoms) พวกแฟนท่อมส์มีความรวดเร็วและหากเข้าประชิดผู้เล่น สามารถสังหารเราได้ด้วยการแทงแค่ดาบเดียว ให้ยิงโจมตีพวกแฟนท่อมส์จากระยะไกลๆ หรือใช้สกิลประเภทหยุดชะงักหรือยกขึ้นจะช่วยต้านความเร็วพวกมันได้ กำจัดแฟนท่อมส์, ทหารเซอร์เบอรัส และ แอตลาส มุ่งหน้าไปที่ลิฟต์ของสภา
เชพเพิร์ดจะใช้ลิฟต์ไล่ตามไคขณะที่กำลังอยู่ด้านบนของลิฟต์ลิฟต์ของศัตรูจะโจมตีผู้เล่น ให้ยิงที่แท่นพลังงานทั้งสองจุดของลิฟต์ศัตรูให้พังเสียหาย และกำจัดทหารเซอร์เบอรัสที่เข้ามาในบริเวณลิฟต์ของเราให้หมด จากนั้นจะต้องกระโดดข้ามเปลี่ยนลิฟต์เมื่อเคลียร์ศัตรูหมดแล้ว
เชพเพิร์ดจะพบแอชลี่ย์และสมาชิกสภาคนอื่นๆพร้อมกับอธิบายให้ทุกคนฟังว่า สมาชิกอูดิน่าเป็นคนอยู่เบื้องหลังของแผนการเซอร์เบอรัสบุกยึดสภาซิทาเดล(ผลลัพธ์การดำเนินเรื่องอยู่ที่การตัดสินใจของผู้เล่น) เมื่อสถานการณ์ของซิทาเดลสงบ ไบลี่ย์จะรายงานว่าตอนนี้กองทัพเซอร์เบอรัสได้ล่าถอยออกไปแล้ว พอบังคับตัวละครได้สำรวจซิทาเดลทำเควสต์รองให้เรียบร้อย กลับไปขึ้นยานนอร์มังดีจะพบแอชลี่ย์ชวนเธอกลับเข้าทีมของเชพเพิร์ด

- ไพรออริตี้: เพอร์ซีอุส เวล(Priority: Perseus Veil) กองยานของชาวควอเรี่ยนส์(Quarian)ที่มีทั้งยานสนับสนุนและผู้เชี่ยวชาญด้านเทคโนโลยี ซึ่งจะเป็นประโยชน์อย่างมากหากชาวควอเรี่ยนส์เข้าร่วมกับเครือข่ายพันธมิตร ให้เชพเพิร์ดไปพบผู้บัญชาการกองยานควอเรี่ยน เพื่อขอความช่วยเหลือในการรวมกำลังต่อต้านกองทัพรีฟเปอร์(Far Rim>Dholen>Quarian Envoy Ship)
เป็นภารกิจสั้นๆเหล่าผู้บัญชาการของกองทัพควอเรี่ยนส์ ได้เข้ามาเจรจาปรึกษากับเชพเพิร์ดในยานนอร์มังดี เชพเพิร์ดจะต้องช่วยชาวควอเรี่ยนส์สู้กับกองทัพเกธเพื่อยึดดาวบ้านเกิดคืน หลังจากนั้นกองทัพควอเรี่ยนส์จะร่วมสนับสนุนสงครามกับฝ่ายพันธมิตร หากมีความสัมพันธ์กับตัวละครทาลี(Tali'Zorah จากเกมภาคที่ 1 และ 2) เธอจะเข้าร่วมทีมเชพเพิร์ดทันที

- ไพรออริตี้: เกธ เดรดนอต(Priority: Geth Dreadnought) ชาวควอเรี่ยนส์กำลังพยายามที่จะยึดดาวบ้านเกิดคืนมาจากกองทัพเกธ(Geth) แต่กองทัพเกธได้รับการปรับปรุงอัพเกรดระบบของรีฟเปอร์ และกองยานควอเรี่ยนติดยู่ในสถานการณ์ที่ย่ำแย่ ให้เชพเพิร์ดเดินทางไปที่ยานเกธ เดรดนอต(Geth Dreadnought) เพื่อปิดสัญญาณเครือข่ายของเดรดนอตที่โดนควบคุมโดยรีฟเปอร์(Perseus Veil>Tikkun>Geth Dreadnought)
เริ่มภารกิจเชพเพิร์ดมาอยู่บริเวณนอกยานเดรดนอต จะต้องแทรกซึมเข้าไปในยานจากการเดินด้วยระบบแรงดึงดูดของชุด เดินหมุนตามพื้นซ้ายและขวาเพื่อหาเส้นทางเชื่อมไปถึงประตูเข้ายาน เมื่อเข้ามาในเดรดนอตให้สำรวจแผงควบคุมประตูแอร์ล็อกจุดที่ 2 จะได้พบเพื่อนทีมในปาร์ตี้ ลุยฝ่าหุ่นเกธไปที่โซนออปเปอเรชั่น เซนเตอร์เส้นทางไม่ซับซ้อนมาก สำรวจที่คอนโซลควบคุมแต่ยังไม่สามารถปิดระบบสัญญาณของรีฟเปอร์ได้

มุ่งหน้าไปที่โซนพลังงานของปืนยานเดรดนอต พื้นที่ส่วนนี้จะมีการส่งพลังงานออกมาตลอดเวลา ต้องหลบคัฟเวอร์ตามจุดกำบังคำนวนระยะการส่งพลังงาน แล้วเคลื่อนที่เดินหน้าไปยังลิฟต์แพลตฟอร์ม จะมีกองทัพเกธออกมาเกะกะขวางเส้นทางให้กำจัดพวกมันด้วย สำรวจลิฟต์แพลตฟอร์มแต่แพลตฟอร์มจะขัดข้อง ต้องเดินเท้าไปต่อจนถึงห้องแกนพลังงาน
สำรวจที่แผงควบคุมแกนพลังงานจะพบลีเจี้ยน(Legion หุ่นเกธโปรแกรมเป็นมิตรกับสิ่งมีชีวิตในเกมส์ภาค 2) สำรวจแผงบล็อคฮาร์ดแวร์อีกหนึ่งจุดจะปิดระบบสัญญาณของรีฟเปอร์และปล่อยตัวลีเจี้ยน กำจัดกองทัพเกธชุดใหญ่ที่ชั้นบนและลงไปหาลีเจี้ยนในชั้นล่าง จากนั้นมุ่งหน้าตามลีเจี้ยนออกไปที่ด้านนอกของยานแล้วทุกคนจะกลับยานนอร์มังดี กองยานควอเรี่ยนจะสาสารถเปิดฉากโจมตีกองทัพเกธได้อย่างเต็มรูปแบบ

- ไพรออริตี้: รันนอช(Priority: Rannoch) ในดาวรันนอชกองทัพรีฟเปอร์ที่ควบคุมฐานบัญชาการอยู่ที่นั้น มีรีฟเปอร์ที่สามารถป้องกันการโจมตีด้วยขีปนาวุธของยานนอร์มังดีได้ เชพเพิร์ดและลูกทีมต้องลงไปที่ดาวรันนอช เพื่อใช้อุปกรณ์ต้นแบบเลเซอร์ชี้พิกัดกำหนดเป้าหมาย ในการยิงขีปนาวุธของนอร์มังดีจากอวกาศไปทำลายรีฟเปอร์ ให้เชพเพิร์ดเปิดกาแล็กซี่แม็พเลือกดาวรันนอช(Perseus Veil>Tikkun>Rannoch)
***หากเควสต์ Priority: Rannoch ไม่มีในกาแล็กซี่แม็พ ให้ทำภารกิจ Geth Fighter Squadrons หรือ Admiral Koris ที่ดาวรันนอชก่อน จากนั้นภารกิจนี้จะปรากฏโดยอัตโนมัติ***
เมื่อเชพเพิร์ดมาถึงฐานกองทัพเกธที่ควบคุมโดยรีฟเปอร์กำจัดศัตรูและปีนเข้าไปด้านใน
จัดการหุ่นดรอยด์เกธตามเส้นทางจนไปถึงแผงควบคุมประตูโอเวอร์ไรด์ ให้กดสำรวจแผงควบคุมทั้ง 2 จุด ขึ้นลิฟต์ไปชั้นบนจะต้องจัดการเกธ ไพรม์(Geth Prime)จำนวน 3 ตัว ให้กำจัดมันทีละตัวโดยเริ่มจากตัวกลาง, ซ้าย และขวา อย่าคัฟเวอร์อยู่ตำแหน่งเดิมที่จะโดนมันทั้ง 3 ตัวเข้ารุม

จากนั้นเดินไปยืนตรงตำแหน่งขอบด้านบนของฐานทัพ เชพเพิร์ดจะเปลี่ยนอาวุธเป็นปืนเลเซอร์ชี้พิกัดกำหนดเป้าหมาย กดปุ่มยิงค้างไว้ที่เป้าหมายสีแดงที่ด้านล่างนอร์มังดีจะยิงขีปนาวุธใส่เป้าหมาย รีฟเปอร์ที่อยู่ด้านล่างของฐานทัพจะปรากฏตัวออกมา ผู้เล่นจะร่วงลงมาที่ชั้นล่างรีบวิ่งไปขึ้นโฮเวอร์คราฟต์เพื่อหนีรีฟเปอร์
้เชพเพิร์ดจะลงจากโฮเวอร์คราฟต์เพื่อกำจัดรีฟเปอร์ เราจะต้องเล็งปืนเลเซอร์ชี้เป้าไปที่จุดสีแดงกลางตัวรีฟเปอร์ เพื่อให้ขีปนาวุธยิงถล่มลงมาจากอวกาศ แต่รีฟเปอร์จะไม่ให้เรายิงฟรีๆ มันจะโจมตีผู้เล่นด้วยลำแสงเลเซอร์ที่ยิงเชพเพิร์ดครั้งเดียวตายเช่นกัน ให้กะจังหวะดีๆใช้วิธีกลิ้งไปทางซ้ายหรือขวาแบบต่อเนื่องเพื่อหลบการโจมตีรีฟเปอร์ แล้วเล็งชาร์จปืนเลเซอร์กำหนดเป้าหมายที่จุดอ่อนของมัน ให้ขีปนาวุธจากอวกาศโจมตีไปเรื่อยๆ 4-5 รอบ ทำแบบเดิมซ้ำๆจะสามารถปราบรีฟเปอร์ลงได้สำเร็จ
เมื่อกำจัดรีฟเปอร์แล้วจะมีบทสนทนาและการเลือกประโยคการสนทนา ซึ่งผู้เล่นจะต้องสูญเสียตัวละครลีเจี้ยน หรือสูญเสียลีเจี้ยนและทาลีทั้ง 2 คนเลย ไม่ว่าการเลือกบทสนทนาจะเป็นอย่างไร เครือข่ายพันธมิตรจะได้กองยานควอเรี่ยนหรือกองยานเกธเข้าร่วมในสงคราม

- ไพรออริตี้: เดอะ ซิทาเดล 3(Priority: The Citadel III) สมาชิกสภาฯชาวอาซาริต้องการปรึกษาพูดคุยกับเชพเพิร์ด เกี่ยวกับสถานการณ์ของสงคราม ให้เชพเพิร์ดไปพบกับสมาชิกสภาอาซาริที่สถานีซิทาเดล(Serpent Nebula>Widow>Citadel)
เป็นภารกิจการสนทนาสั้นๆกับสมาชิกสภาอาซาริที่ห้องทำงานเก่าของอูดิน่า ในชั้นซิทาเดล แอมบาสซี่ส์ สมาชิกสภาเธอจะแจ้งถึงสถานการณ์ของสาธารณรัฐชาวอาซาริ ที่ย่ำแย่ลงอย่างมากจากสภาวะของสงคราม และกล่าวถึงเรื่องอารยธรรมของชาวโพรเธี่ยนส์ที่ถูกซ่อนอยู่ในวิหารอาธาเมะ บนดาวของชาวอาซาริ

- ไพรออริตี้: เธสเซีย(Priority: Thessia) ชาวอาซาริส์กำลังหมดความหวัง ภายหลังจากที่โดนกองทัพรีฟเปอร์รุกรานดาวบ้านเกิดอย่างหนัก การโจมตีของรีฟเปอร์ได้เปิดเผยตำแหน่งของสิ่งประดิษฐ์โบราณ ซึ่งเป็นกุญแจสำคัญในการค้นหาแคททาลิสต์(Catalyst) เครื่องมือชิ้นสำคัญที่จะทำให้อุปกรณ์ครูซิเบิ้ลเสร็จสมบูรณ์ ให้เชพเพิร์ดมุ่งหน้าไปที่ดาวเธสเซีย(Thessia) เพื่อพบกับชาวอาซาริและนำอารยธรรมชาวโพรเธี่ยนส์ไปค้นหาแคททาลิสต์(Athena Nebula>Parnitha>Thessia)
เมื่อมาถึงดาวเธสเซียพูดคุยกับหัวหน้าหน่วยรบชาวอาซาริที่อยู่ใกล้ๆจุดเริ่มภารกิจ เชพเพิร์ดจะต้องใช้ป้อมปืนช่วยยิงต่อต้านฝูงฮัสค์ที่จุดนี้ก่อน ทหารอาซาริเธอจะให้ข้อมูลพิกัดเส้นทางวิหารอาธาเมะ(Temple of Athame) ลุยฝ่ากองทัพรีฟเปอร์ไปที่ด่านหน้าไทคิส ระหว่างเดินทางจะพบศัตรูเเบนชี(Banshee)สายพันธุ์ดัดแปลงเวทย์ไบโอติกส์ที่มีเกราะชิลด์และอาร์เมอร์ที่หนามาก แบนชีเดินเคลื่อนไหวช้าแต่สามารถเทเลพอร์ตวาร์ปได้ หากได้เข้าใกล้ผู้เล่นเธอจะโจมตีกะซวกไส้เราจนตายในครั้งเดียว เว้นระยะห่างๆจากแบนชีหลบพลังเวทย์และการกะซวก ยิงตอบโต้จากระยะไกลให้เกราะแตกเป็นวิธีฆ่าแบนชีที่ปลอดภัยที่สุด
***หากเกราะชิลด์สีฟ้าของศัตรูฟื้นฟูรวดเร็วหรือทำลายเกราะไม่ได้ ให้หาเสาหรือเครื่องส่งสัญญาณปกป้องเกราะของศัตรูแล้วทำลายมัน คล้ายๆกล่องส่งสัญญาณตามผนังหรือตู้ตั้งพื้นรอบๆพื้นที่ต่อสู้ ศัตรูจะมีอุปกรณ์แบบนี้ทั้งฝ่ายรีฟเปอร์และทหารเซอร์เบอรัส***

บริเวณด่านหน้าไทคิสกำจัดกองทัพรีฟเปอร์มุ่งหน้าไปที่วิหาร จะพบฮาร์เวสเตอร์ส(Harvesters)ศัตรูตัวนี้หากมีไรเฟิลซุ่มยิงแรงๆ สามารถฆ่ามันจากระยะไกลได้ แต่ตอนนี้แนะนำแค่หลบการโจมตีของฮาร์เวสเตอร์ส แล้วเปลี่ยนจุดคัฟเวอร์ไปที่ด้านหน้า ฮอจู่โจมชาวอาซาริจะบินมายิงขับไล่ล่อพวกมันออกไปเอง สำรวจสวิตช์หน้าวิหารและเข้าไปที่ด้านใน
ให้สำรวจแท่นตรงกลางรูปปั้นในวิหารและจะต้องสำรวจมรดกโบราณอื่นๆเพิ่มเติม เมื่อสำรวจครบทุกตำแหน่งบีค่อนเวนเดทต้า(VendettaVI)จะปรากฏ บีค่อนเวนเดทต้าคืออุปกรณ์เอไอบันทึกเหตุการณ์ต่างๆในอดีตของชาวโพรเธี่ยนส์ ในขณะที่เชพเพิร์ดกำลังสอบถามเวนเดทต้าเกี่ยวกับแคททาลิสต์ ไค เล้งกับทหารเซอร์เบอรัสได้บุกเข้ามาภายในวิหาร อิลลูซีฟแมนจะสื่อสารกับเชพเพิร์ดผ่านโฮโลแกรม และจะต้องสู้กับบอสไคเล้ง
ไคเล้งมีรูปแบบการโจมตีเหมือนพวกแฟนท่อมส์และสามารถใช้พลังไบโอติกส์ได้ ให้เว้นระยะห่างหลบการโจมตีแล้วยิงตอบโต้ไคเล้งจากระยะไกล โยนเวทย์ทั้งปาร์ตี้ใส่ไคเล้งบ่อยๆ สู้ไปซักพักเฮลิคอปเตอร์เซอร์เบอรัสจะยิงถล่มใส่ผู้เล่น ไคเล้งจะสามารถเข้าไปอัพโหลดบีค่อนเวนเดทต้า เพื่อเอาข้อมูลแคททาลิสต์ไปให้อิลลูซีฟแมนได้ และสุดท้ายกองทัพรีฟเปอร์ก็รุกรานดาวเธสเซียจนยึดครองได้สำเร็จ

- ไพรออริตี้: ฮอไรซอน(Priority: Horizon) ขณะนี้องค์กรเซอร์เบอรัสอาจใช้เทคโนโลยีของสถาบันวิจัยแห่งสำคัญ ทำการทดลองสายพันธุ์พืชอยู่บนดาวฮอไรซอน(Horizon) ให้เชพเพิร์ดไปที่ดาวฮอไรซอนเพื่อตรวจสอบงานทดลองวิจัยของเซอร์เบอรัส ที่เกิดขึ้นอยู่ที่สถาบันนั้น(Shadow Sea>Iera>Horizon)
เมื่อไปถึงสถาบันกำจัดพวกแฟนท่อมส์แล้วเข้าไปในอาคารด้านใน ภายในสภาบันจะมีพวกทหารเซอร์เบอรัสตามเส้นทางเคลียร์ศัตรูลงไปที่โซนงานทดลอง ที่ด้านล่างศัตรูประเภทกองทัพรีฟเปอร์จะพบอยู่รอบๆบริเวณโซนทดลอง ระวังแบนชีเข้ามากะซวกผู้เล่นในระยะใกล้ด้วย
เชพเพิร์ดจะทราบว่างานวิจัยต่างๆในสถาบันกำลังส่งข้อมูลไปให้อิลลูซีฟแมน โดยคนที่ร่วมมือกับเซอร์เบอรัสภายในสถาบันนี้คือเฮนรี่(Henry Lawson พ่อของตัวละครมิแรนด้าในภาคที่ 2) เป้าหมายของเชพเพิร์ดคือต้องไปช่วยเหลือโอเรียน่า(Oriana ลูกสาวของเฮนรี่อีกหนึ่งคนพี่น้องกับมิแรนด้า) ที่อาคารหอรักษาความปลอดภัยของสถาบัน

ปีนบันไดจากโซนทดลองขึ้นไปชั้นบนลุยฝ่ามาเราเดอร์(Marauder) และ ราเวเจอร์(Ravager) กระโดดขึ้นไปบนรถรางยิงที่แผงควบคุมเปิดฝากดสำรวจเพื่อเคลื่อนย้ายรถรางไปด้านหน้า เตรียมตัวให้พร้อมเพราะพื้นที่ถัดไปจะต้องสู้กับบรู๊ต 3 ตัวและแบนชี 1 ตัว
พื้นที่ค่อนข้างกว้างและมีจุดหลบคัฟเวอร์เวอร์หลายตำแหน่ง แต่ระวังเดินหรือวิ่งไปติดมุมกำบังตอนกำลังต่อสู้ เริ่มจากใช้อาวุธประชิดหนักๆพวกลูกซองกับระเบิดมือสกิลแรงๆ กำจัดบรู๊ตทั้ง 3 ตัวก่อน จากนั้นก็หาพื้นที่เพื่อฆ่าแบนชีจากระยะไกล เพื่อจัดการศัตรูแล้วขึ้นลิฟต์ไปชั้นบนเข้าห้องรักษาความปลอดภัย
มีคัตซีนและการเลือกประโยคสนทนาในการช่วยโอเรียน่า (หากมีบันทึกเกมจากภาค 2 จะพบมิแรนด้าในคัตซีนนี้ด้วย)
เมื่อเสร็จสิ้นภารกิจที่ยานนอร์มังดีแฮ็คเก็ตต์(หรือมิแรนด้า) จะให้ข้อมูลฐานบัญชาการองค์กรเซอร์เบอรัสกับเชพเพิร์ด ในการหยุดหยั้งแผนการของอิลลูซีฟแมน

องก์ที่ 3(Act III)
***การเริ่มเควสต์ Priority: Cerberus Headquarters จะเข้าสู่เนื้อหาในบทที่ 3 ของเกม ผู้เล่นจะไม่สามารถทำภารกิจเควสต์รองหรือดีแอลซี, สำรวจดวงดาวเพื่อค้าหาไอเท็มอัพเกรดเพิ่มค่าทรัพยากรสงคราม และ กลับสถานีซิทาเดลได้จนกว่าจะจบองก์ที่ 3(สามารถซื้อไอเท็มและอัพเกรดเกราะอาวุธบนนอร์มีงดีได้) หากมีเควสต์หรืออื่นๆที่ต้องทำควรทำก่อนเข้าภารกิจนี้***

- ไพรออริตี้: เซอร์เบอรัส เฮดควอร์เตอร์ส(Priority: Cerberus Headquarters) สถานีโครโนส(Cronos Station)เป็นฐานบัญชาการของอิลลูซีฟแมนและกองทัพเซอร์เบอรัส ฝ่ายเครือข่ายพันธมิตรเตรียมบุกโจมตีสถานีโครโนส เพื่อกู้คืนอุปกรณ์บีค่อนโพรเธียนส์ที่ 6 ที่มีข้อมูลสำคัญของแคททาลิสต์ การโจมตีครั้งนี้จะนำไปสู่การตอบโต้ครั้งสุดท้ายของฝ่ายเครือข่ายพันธมิตร ในสงครามกับกองทัพรีฟเปอร์ เมื่อเชพเพิร์ดและลูกทีมพร้อมให้ไปที่สถานีโครโนส(Horsehead Nebula>Anadius>Cronos Station)
เมื่อไปถึงสถานีโครโนสเชพเพิร์ดจะมาอยู่บริเวณลานขนส่งยานบินเล็ก กำจัดทหารเซอร์เบอรัสและขึ้นไปชั้นบนสำรวจแผงควบคุมปิดระบบยานบินเล็ก สำรวจแผงควบคุมอีกหนึ่งจุดแล้วกลับลงไปที่ชั้นล่าง สำรวจแผงควบคุมจุดสุดท้ายใกล้ยานบินเล็ก ยานบินเล็กจะยิงมิสไซล์ทำลายผนังเปิดเส้นทางเข้าสถานี พร้อมกับศัตรูอีก 1 ชุดและหุ่นแอตลาสสามตัวที่ต้องจัดการ เข้าไปด้านในสถานี
ลุยฝ่าศัตรูขึ้นไปที่เซนทรัล แล็ป
เข้าไปในห้องเซนทรัล แล็ปเชพเพิร์ดจะเปิดระบบบีค่อนโพรเธี่ยนส์ที่ 6 และมีบทสนทนาระหว่างเชพเพิร์ดกับอิลลูซีฟแมนและเวนเดทต้าที่ 6

(แคททาลิสต์คือสสารมืดที่ควบคุมระบบปัญญาประดิษฐ์ทั้งหมด ทั้งระบบแมสส์ รีเลย์สทั่วกาแล็กซี่ ทั้งเปิดระบบรีฟเปอร์เก็บเกี่ยวสิ่งมีชีวิตทั้งหมดตามวัฏจักร เพื่อนำสิ่งชีวิตมาดัดแปลงเป็นเครื่องจักร และสถานีซิทาเดลแท้จริงแล้วคือระบบเอ.ไอ.แคททาลิสต์
ครูซิเบิ้ลคืออุปกรณ์แหล่งพลังงานที่กองทัพรีฟเปอร์และแคททาลิสต์ ไม่สามารถเข้าใจและควบคุมระบบการทำงานพลังงานครูซิเบิ้ลได้ เนื่องจากมันถูกออกแบบและคิดค้นระบบโดยสสารอินทรีย์สิ่งมีชีวิตเมื่อนานมาแล้ว
ฝ่ายรีฟเปอร์และแคททาลิสต์ต้องการให้ลูปวัฏจักรดำเนินต่อไป โดยการเก็บเกี่ยวสสารอินทรีย์เมื่อพัฒนาการเติบโตถึงจุดที่เหมาะสม และดัดแปลงให้สิ่งมีชีวิตเป็นส่วนหนึ่งใน"เครื่องจักรรีฟเปอร์" จากนั้นรีบเปอร์ก็รอการเก็บเกี่ยวสสารอินทรีย์ในกาแล็กซี่ครั้งถัดไป เมื่ออารยธรรมและพัฒนาการถึงจุดที่กำหนด
ฝ่ายเครือข่ายพันธมิตรต้องการใช้ครูซิเบิ้ลทำลายวงจรเครื่องจักรทั้งหมด ยุติวัฏจักรเก็บเกี่ยวสิ่งมีชีวิตสสารอินทรีย์ ฝ่ายอิลลูซีฟแมนต้องการใช้ครูซิเบิัลควบคุมวงจรเครื่องจักรทั้งหมด รักษาวัฏจักรเก็บเกี่ยวสิ่งมีชีวิตสสารอินทรีย์โดยมีมนุษย์เป็นผู้ควบคุมเครื่องจักร)

หลังจากคัตซีนจบบอสไคเล้งจะปรากฏตัวออกมาและต้องสู้ไคเล้ง รูปแบบการโจมตีไคเล้งจะเหมือนที่เคยสู้ในวิหาร แต่เมื่อบอสโดนลดค่าความเสียหายมันจะทุบพื้นและชาร์จพลังเกราะ ระหว่างไคเล้งเพิ่มพลังงานจะไม่สามารถสร้างความเสียหายมันได้ ให้กำจัดทหารเซอร์เบอรัสรอบๆบริเวณให้หมด จากนั้นไคเล้งจะกลับมาสู้และพอค่าเกราะบอสลดมันจะทุบพื้นอีก สู้แบบเดิมวนไปเรื่อยๆไคเล้งจะทุบพื้นชาร์จเกราะจุดสุดท้าย ให้ระดมโจมตีอาวุธสกิลหนักๆทุกอย่างจะสามารถกำจัดบอสไคเล้งได้สำเร็จ
บนยานนอร์มังดีแฮคเก็ตต์จะติดต่อถึงเชพเพิร์ด และยืนยันว่าสถานีซิทาเดล(หรือแคททาลิสต์)ตอนนี้ได้โคจรอยู่ที่ดาวโลก (ในกาแล็กซี่แม็พผู้เล่นจะไม่สามารถไปตำแหน่งอื่นนอกจากภารกิจสุดท้ายได้ แต่ยังซื้อและอัพเกรดอาวุธบนนอร์มังดีได้ปกติ)

- ไพรออริตี้: เอิร์ธ(Priority: Earth) กองกำลังภาคพื้นของฝ่ายเครือข่ายพันธมิตรกำลังรุกตีกองทัพรีฟเปอร์บนดาวโลก หน่วยแฮมเมอร์จะต้องนำทหารแนวหน้าเข้าไปที่สถานีซิทาเดล เพื่อเปิดสัญญาณของครูซิเบิ้ลให้เชื่อมระบบกับซิทาเดล เชพเพิร์ดจะร่วมประสานงานกับแอนเดอร์สันเพื่อไปที่ลำแสงเคลื่อนย้ายของซิทาเดล(Local Cluster>Sol>Earth)
เเฮคเก็ตต์จะเป็นผู้บัญชาการนำกองยานเครือข่ายพันธมิตรออกรบกับรีฟเปอร์ ส่วนเชพเพิร์ดจะลงไปที่โลกและหาวิธีกลับขึ้นไปที่สถานีซิทาเดล
เมื่อบังคับตัวละครได้ลุยฝ่ากองทัพทหารรีฟเปอร์ขึ้นไปที่ซากยานลำเลียงบนอาคาร หยิบปืน เอ็ม-920 ที่ข้างซากยาน เล็งยิงชี้พิกัดไปที่ฮาเดส แคนนอนของรีฟเปอร์มันจะถูกขีปนาวุธยิงทำลาย จากนั้นจะต้องกำจัดฝูงคานนิบัลที่ออกมาเรื่อยๆและระวังแบนชีด้วย ยานลำเลียงของแอนเดอร์สันจะบินมารอรับเชพเพิร์ด ให้รีบวิ่งไปที่ยานลำเลียงผู้เล่นจะกระโดดเข้าไปในยานมุ่งหน้าไปแคมป์ของทหารแนวหน้า
พูดคุยกับตัวละครต่างๆเป็นครั้งสุดท้ายรอบๆจุดพักแล้วขึ้นไปพบแอนเดอร์สัน (จะต้องใช้ป้อมปืนยิงศัตรูที่หน้าแคมป์เล็กน้อย ระหว่างที่ไปพบแอนเดอร์สัน)

หลังจากที่มีการวางแผนและประชุมเป็นครั้งสุดท้ายแล้วแอนเดอร์สันจะสั่งเริ่มภารกิจ ลุยฝ่าทหารรีฟเปอร์มากมายหลายประเภท(ฮาร์เวสเตอร์สกับแบนชีให้โจมตีจากระยะไกล ส่วนบรู๊ตให้ใช้อาวุธแรงๆระยะประชิดกำจัด) ข้ามเส้นทางโน-แมน'ส์-แลนด์ไปฐานที่มั่นตามจุดหมาย
ขบวนรถยานเกราะที่ขนขีปนาวุธไปทำลายรีฟเปอร์เกิดติดปัญหา ให้เคลียร์จัดการศัตรูรอบๆกลางสี่แยกที่รถยานเกราะเกิดปัญหา ระวังเลเซอร์ของรีฟเปอร์โจมตีจากระยะไกลที่โดนครั้งเดียวจะตายทันที ต้านศัตรูทุกประเภทจากทุกทิศทาง คัฟเวอร์หลบการโจมตีของรีฟเปอร์ สำรวจคอนโซลควบคุมขีปนาวุธที่รถยานเกราะทั้ง 2 คันเพื่อทำลายรีฟเปอร์ จะเข้าสู่ช่วงสุดท้ายของการต่อสู้
เชพเพิร์ดจะมาอยู่ที่ด้านหน้าลำแสงเคลื่อนย้ายของซิทาเดล รีบวิ่งไปที่ลำแสงสีฟ้าผู้เล่นจะพลาดถูกโจมตีจนได้รับบาดเจ็บ ให้เดินด้วยอาการบาดเจ็บกำจัดทหารรีฟเปอร์เข้าไปในลำแสง เชพเพิร์ดจะถูกวาร์ปเทเลพอร์ตขึ้นไปในสถานีซิทาเดล

เมื่อขึ้นมาบนสถานีซิทาเดล(แคททาลิสต์)ได้แล้ว เกมเพลย์ต่อจากนี้จะไม่มีการต่อสู้กับศัตรู เดินมุ่งหน้าตามเส้นทางตรงๆไปที่ส่วนควบคุมหลักจะพบแอนเดอร์สันและอิลลูซีฟแมน อิลลูซีฟแมนจะแสดงวิธีการควบคุมสิ่งมีชีวิตและเครื่องจักรจากการทดลองวิจัยของเซอร์เบอรัส ก่อนที่จะควบคุมผู้เล่นให้สังหารแอนเดอร์สัน ผู้เล่นสามารถเลือกสังหารอิลลูซีฟแมนด้วยตัวเองหรือปล่อยให้อิลลูซีฟแมนฆ่าตัวตาย ก็ขึ้นอยู่กับการเลือกประโยคบทสนทนา(และมีควิก ไทม์ อีเว้นท์สำคัญ) จากนั้นเชพเพิร์ดจะเปิดระบบเชื่อมต่อครูซิเบิ้ลกับซิทาเดล(แคททาลิสต์)
เชพเพิร์ดจะได้พบสสารมืดแคททาลิสต์ที่ควบคุมเครื่องจักรทุกอย่าง ภายในกายหยาบรูปร่าง เอ.ไอ.ที่หน้าตาคล้ายเด็กคนที่อยู่ในฝันร้ายของเชพเพิร์ด เมื่อสนทนาสอบถามข้อมูลต่างๆเสร็จสิ้นแล้ว ผู้เล่นจะต้องเลือกบทสรุปเกมส์ของไตรภาคมาสส์ เอฟเฟคต์ด้วยต้นเองครับ
- (สีฟ้า)เดินไปด้านซ้ายแล้วกดสำรวจเชพเพิร์ดจะควบคุมสิ่งมีชีวิตออร์แกนนิคกับสิ่งสังเคราะห์ซินเธติค และได้เป็นอมตะกายหยาบในรูบแบบรีฟเปอร์
- (สีเขียว)เดินเข้าไปตรงกลางลำแสงทุกสิ่งในกาแล็กซี่จะกลายเป็นสิ่งสังเคราะห์ซินเธติค เครื่องจักรจะชนะสงครามและกาแล็กซี่ก็กลับมาสงบสุขอีกครั้ง
- (สีส้ม)เดินไปด้านขวาให้เชพเพิร์ดยิงทำลายแผงควบคุม เครื่องจักรและสิ่งสังเคราะห์จะถูกกำจัด สิ่งมีชีวิตออร์แกนนิคจะชนะสงครามและกาแล็กซี่ก็กลับมาสงบสุขอีกครั้ง

ข้อมูลและอ้างอิงจาก: วิกิพีเดีย และ แมสส์ เอฟเฟคต์ แฟนดอม